Syno?C 引物合成
RNA合成
mRNA合成
Syno?GS 基因合成
載體構(gòu)建
高通量及DNA文庫(kù)構(gòu)建
CRISPR基因編輯平臺(tái)
病毒包裝
基因測(cè)序及分析
重組蛋白表達(dá)平臺(tái)
抗體工程平臺(tái)
多肽服務(wù)
生物信息學(xué)分析與設(shè)計(jì)
CRISPR文庫(kù)
合成生物學(xué)產(chǎn)品
ProXpress蛋白快速檢測(cè)
CRISPR 質(zhì)粒
精準(zhǔn)突變文庫(kù)：定向進(jìn)化的“高效引擎”
前言
分子定向進(jìn)化是利用現(xiàn)代分子生物學(xué)方法，人為模擬自然進(jìn)化機(jī)制，人工合成大量的突變同源基因文庫(kù)。采用靈敏的定向篩選策略，創(chuàng)造出自然界不存在的或某些特性有顯著改變的突變蛋白質(zhì)或其他生物分子。
01
精準(zhǔn)突變文庫(kù)類型
精準(zhǔn)突變文庫(kù)，融合了基因合成、基因突變和定向進(jìn)化研究的精華。它通過(guò)改變蛋白質(zhì)的特定位點(diǎn)或DNA的調(diào)控區(qū)域，來(lái)研究結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)系。突變文庫(kù)的主要類型包括：
丙氨酸掃描文庫(kù)
Alanine Scan Library
實(shí)現(xiàn)全面突變覆蓋的高級(jí)策略
利用丙氨酸體積小同時(shí)對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)影響較小的特性，科學(xué)家通過(guò)丙氨酸系統(tǒng)地取代其他19個(gè)氨基酸殘基的每一個(gè)，構(gòu)建了丙氨酸掃描文庫(kù)。這種創(chuàng)新方法通過(guò)探索單個(gè)氨基酸殘基在蛋白質(zhì)功能、活性位點(diǎn)和穩(wěn)定性中的作用，解開(kāi)了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的秘密。
定點(diǎn)飽和突變文庫(kù)
Site-Saturation Mutagenesis Library
實(shí)現(xiàn)單點(diǎn)氨基酸的精確突變
將蛋白序列限定區(qū)域內(nèi)的氨基酸位點(diǎn)突變成另外的19種氨基酸，構(gòu)成定點(diǎn)飽和突變文庫(kù)。一次只突變一個(gè)氨基酸位點(diǎn)，每條序列和模板相比只存在一個(gè)氨基酸位點(diǎn)突變。這可以大幅降低引物合成成本，對(duì)于突變位點(diǎn)多的高庫(kù)容文庫(kù)極具優(yōu)勢(shì)。
組合突變文庫(kù)
Combinatorial Mutagenesis Library
實(shí)現(xiàn)多點(diǎn)多種氨基酸的精確突變
將蛋白序列的限定區(qū)域內(nèi)連續(xù)的幾個(gè)氨基酸位點(diǎn)同時(shí)突變成另外的19種氨基酸，構(gòu)成組合突變文庫(kù)。同時(shí)突變多個(gè)氨基酸位點(diǎn)，每條序列和模板相比存在多個(gè)氨基酸位點(diǎn)突變。為研究復(fù)雜蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系以及進(jìn)行蛋白工程、抗體研究提供了強(qiáng)大的實(shí)驗(yàn)工具。
02
精準(zhǔn)突變文庫(kù)構(gòu)建流程
精確突變庫(kù)旨在為研究人員提供高度精確的基因突變資源。根據(jù)設(shè)計(jì)目的不同，體外合成的精準(zhǔn)突變文庫(kù)可以更精確、更隨意地控制所研究序列的多樣性，有助于深入探究基因功能和調(diào)控機(jī)制?；谛酒瑯?gòu)建精準(zhǔn)突變文庫(kù)的流程如下：
-
通過(guò)芯片引物引入突變。 -
對(duì)樣品中的DNA進(jìn)行大量PCR擴(kuò)增。 -
將dsDNA片段無(wú)縫組裝到質(zhì)粒上。 -
對(duì)得到的突變文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證及數(shù)據(jù)分析。
03
精準(zhǔn)突變文庫(kù)的應(yīng)用領(lǐng)域
定向進(jìn)化研究：構(gòu)建突變文庫(kù)有助于探索基因的功能和調(diào)控機(jī)制，推動(dòng)基礎(chǔ)科學(xué)研究的進(jìn)展。
酶工程改造：用于改良酶的催化性能和微生物的代謝途徑，為酶工程提供高效、精準(zhǔn)的生物工具。
生物醫(yī)藥領(lǐng)域：用于篩選藥物靶點(diǎn)的關(guān)鍵功能區(qū)域，發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的新藥物靶點(diǎn)，促進(jìn)新藥開(kāi)發(fā)和研究。
農(nóng)業(yè)領(lǐng)域：有助于篩選具有改良性狀的抗體、配體及受體，提高作物產(chǎn)量、抗病性和適應(yīng)性。
食品領(lǐng)域：針對(duì)食品中存在的特定蛋白質(zhì)進(jìn)行定向進(jìn)化，改善其功能性和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值，有助于提升食品的品質(zhì)和營(yíng)養(yǎng)水平。
Synbio Technology
合成生物學(xué)賦能技術(shù)平臺(tái)
泓迅生物依托領(lǐng)先設(shè)計(jì)和先進(jìn)制造成功交付了數(shù)百個(gè)高質(zhì)量、定制庫(kù)化的精準(zhǔn)突變文庫(kù)。我們根據(jù)您的需求，精心設(shè)計(jì)并合成各種DNA精準(zhǔn)突變文庫(kù)，為您提供定制化基因突變文庫(kù)解決方案。
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
序列控制精準(zhǔn)
合成效率高
高度定制化
高性價(jià)比方案
泓迅案例
NNK文庫(kù)是一種經(jīng)典的簡(jiǎn)并突變文庫(kù)，所使用的 NNK簡(jiǎn)并引物包含了32(4x4x2)種密碼子組合(N= A/C/G/T, K= G/T)，覆蓋了所有20種氨基酸，可以將任意位點(diǎn)的氨基酸進(jìn)行飽和突變。
NNK文庫(kù)，5個(gè)NNK位點(diǎn)所包含的每種密碼子的比例
References
[1] Wang Y, Xue P, Cao M, Yu T, Lane ST, Zhao H. Directed Evolution: Methodologies and Applications. Chem Rev. 2021 Oct 27;121(20):12384-12444.
[2] Yu Q, Li Y, Wu B, Hu W, He M, Hu G. Novel mutagenesis and screening technologies for food microorganisms: advances and prospects. Appl Microbiol Biotechnol. 2020 Feb;104(4):1517-1531.
[3] Wang TW, Zhu H, Ma XY, Zhang T, Ma YS, Wei DZ. Mutant library construction in directed molecular evolution: casting a wider net. Mol Biotechnol. 2006 Sep;34(1):55-68.
[4] Williams G J, Domann S, Nelson A, et al. Modifying the stereochemistry of an enzyme-catalyzed reaction by directed evolution[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2003, 100(6): 3143-3148.
