文獻分享 | 非互補DNA神經(jīng)網(wǎng)絡:試管中“永生”的分子大腦
近年來,人工智能的快速發(fā)展離不開神經(jīng)網(wǎng)絡算法的支撐。然而,電子計算在能效和并行處理方面存在瓶頸,尤其是內(nèi)存與計算單元分離導致的能耗問題日益突出。在這一背景下,DNA計算因其高能效、高并行性和分子級信息處理能力,成為下一代計算模式的有力競爭者。
DNA神經(jīng)網(wǎng)絡:用分子搭建的“微型大腦”
想象一下,我們能用生命的遺傳分子——DNA,在試管里搭建一個微型的“大腦”,讓它能像人腦一樣識別圖案、做出決策。這就是DNA神經(jīng)網(wǎng)絡,一個融合了生物學與計算機科學的前沿領域。
1. 靈感來源:生物大腦
傳統(tǒng)人工智能(AI)的運行依賴于硅基芯片和電流信號。而DNA神經(jīng)網(wǎng)絡的靈感,直接來源于我們的大腦。
大腦如何工作:大腦由無數(shù)神經(jīng)元相互連接而成。每個神經(jīng)元從其他神經(jīng)元接收化學信號(輸入),進行加權匯總。如果總信號超過某個閾值,這個神經(jīng)元就會“激活”,向其他神經(jīng)元發(fā)出信號(輸出)。
2. DNA神經(jīng)網(wǎng)絡:用分子模擬這個過程
DNA神經(jīng)網(wǎng)絡的核心思想是:用DNA分子和它們的化學反應,來模擬大腦中神經(jīng)元的計算過程。
硬件替換:將電子硬件和軟件代碼,替換為DNA單鏈/雙鏈和鏈置換反應。
信號編碼:信息不再由0和1的電流表示,而是由特定DNA序列的有無或濃度來表示。
計算過程:DNA鏈之間的特異性雜交和置換反應,就像神經(jīng)元之間的信號傳遞。
為什么需要非互補DNA設計?
傳統(tǒng)的DNA計算嚴重依賴于完美的堿基互補配對(A-T, C-G)。這種配對非常牢固,但往往意味著反應是不可逆的——就像搭積木時用了超強膠水,一旦搭好就很難拆開重用。
近日,西湖大學研究團隊,在國際化學頂級期刊《Journal of the American Chemical Society》 上發(fā)表了題為 《Reusable Noncomplementary DNA-Based Neural Network》 的重要研究成果,首次成功構建了可重復使用的DNA神經(jīng)網(wǎng)絡,為分子人工智能的發(fā)展邁出了關鍵一步。
西湖大學團隊開創(chuàng)性地提出了“非互補DNA感知器” 的設計理念:
- 可逆計算:通過在DNA雙鏈中引入特定錯配,使鏈置換反應變得可逆,神經(jīng)網(wǎng)絡在完成計算后可恢復初始狀態(tài)。
- “贏家通吃”決策:引入“殲滅鏈”放大微弱信號差異,實現(xiàn)清晰的分子級決策。
- 可移除輸入:創(chuàng)新性地使用脂質-寡核苷酸綴合物作為輸入鏈,利用其極性差異,在計算后通過簡易色譜技術將輸入鏈從網(wǎng)絡中物理移除,從而實現(xiàn)了整個神經(jīng)網(wǎng)絡系統(tǒng)的重復使用。
他們采用的 “非互補”設計,故意在DNA雙鏈中引入一些“錯配”(就像積木的卡扣不那么嚴絲合縫),使得整個反應變得可逆。計算完成后,通過簡單操作就能讓系統(tǒng)“恢復原樣”,從而實現(xiàn)重復使用,這是實現(xiàn)分子“學習”功能的關鍵一步。
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DNA神經(jīng)網(wǎng)絡,本質上是利用DNA分子作為“硬件”,通過模擬大腦的計算原理,在微觀尺度上構建的一種信息處理系統(tǒng)。旨在用生命的語言,實現(xiàn)機器的智能。
DNA神經(jīng)網(wǎng)絡對鏈序列的精確性和純度有極高要求,任何偏差都可能導致計算錯誤。泓迅生物憑借先進的合成與純化平臺,確保了每一條DNA鏈的準確性與可靠性,為實驗的可重復性和成功提供了堅實保障。
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Sun C, Liu X, Zhong J, Zhou Q, Cheng J. Reusable Noncomplementary DNA-Based Neural Network. J Am Chem Soc. 2025 Sep 24;147(38):34339-34349. doi: 10.1021/jacs.5c04886.
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